东莞市在生态环境保护大会暨污染防治攻坚战现场推进会印发《东莞市打好污染防治攻坚战三年行动计划（2018-2020年）》（征求意见稿），《行动计划》就保障考核断面水质、实施截污通水工程、加快污水处理设施建设、消除黑臭水体、深化重点流域综合整治、全面加强河涌污染整治、全面加强入河排污口整治、实施水环境扩容提质、加强近岸海域环境保护、强化饮用水源保护等10个方面提出了工作目标、确定了工作重点和实施单位，确保打赢水污染治理攻坚战。
根据《行动计划》，到2020 年，东莞市7个国考省考断面水质总体提升，考核断面优良水体比例达到57.1%。为达到这一目标，东莞市将积极实施水污染治理八大专项行动，同时加快补齐截污管网建设短板，推进污水处理设施建设，因地制宜建设分散式污水处理设施。此外，东莞市重点开展雨污分流工程，大力推进住宅区、居民区雨污分流管网改造，确保“雨水入河、污水入厂”，解决雨期污水溢流进入河道问题。
在截污通水工程方面，到2020年年底，确保90%以上已建成截污次支管网通水运营。同时，全面加快污水处理设施建设，到2019年，基本完成全市污水处理设施建设。到2020年底，城市建成区污水处理率达到95%以上，各镇污水处理率力争达到90%。
根据《行动计划》，到2020年，东莞市城市建成区基本消除黑臭水体。东莞市将严控污水直排入河，整治入河排污口，全面清理沿岸垃圾和水面漂浮物，因地制宜实施生态修复工程，全面推进22条黑臭水体整治。
在重点流域综合整治方面，目标是到2020年石马河旗岭断面水质达Ⅴ类，茅洲河共和村断面水质达Ⅴ类。对此，东莞市将全面加强石马河流域上下游、左右岸、支干流治污统筹。在茅洲河流域，将通过补齐管网短板，完成界河段和9条支流综合整治，2019年上半年基本实现无污水直排入河，2020年实现雨污分流。
内河涌整治是全市水污染治理攻坚战的主战场，到2020年，全市将完成不少于260条内河涌综合整治并消除黑臭，争取全面消除劣Ⅴ类。此外，到2020年，东莞市将完成入河排污口整治，并建立完善入河排污口管理系统。根据《行动计划》，东莞市全力确保饮用水水源安全，到2020年，城市集中式饮用水水源和镇级集中式饮用水水源水质全部达到或优于Ⅲ类，完成饮用水水源保护区内环境违法问题清理整治。
